近年来，对于“壳公司”的现实应用成了税收监管的一个普遍切入点。许多企业是通过转让一家位于避税港或低税率地区又无经营实质的“壳公司”，间接实现转让我国居民企业的目的。对于这种情况，税务机关有权根据税收法规和税收协定的规定穿透该“壳公司”，认定间接公司转让费用所得为来源于中国境内的所得。关于公司转让的费用需要总结下。
除此之外，不管是直接公司转让费用还是间接公司转让，最为关键的一环是对转让当时股权的价值评估。因为，对转让股权的价值评估会对转让所得的确定和处理有直接影响。然而，股权价值的评估并不像货物价值评估来得容易，其信息采集、数据计算更为复杂。
1、价值评估的重要性
对转让股权的价值评估直接关系到转让所得的确定和处理，在公司转让费用税务处理中位置重要，可以说是基础所在。根据《财政部、国家税务总局关于企业重组业务企业所得税处理若干问题的通知》(财税〔2009〕59 号)及《国家税务总局关于发布〈企业重组业务企业所得税管理办法〉的公告》(国家税务总局公告2010年第4 号)(以下简称“4号公告”)，针对企业重组中发生的所有公司转让费用，企业必须提供评估报告或其他合法凭证，以证明被转让股权的公允价值。
2、价值评估的主要方法
《企业所得税法》规定公司转让费用需按照公允价值进行。无论是关联方间的公司转让费用还是第三方间的公司转让费用，都应当采用股权的公允价值来确定转让收益。
理论上，迄今为止中国尚未出台任何税务法规以明确如何评估各类企业重组中涉及资产的公允价值。实务中常用的评估方法主要包括成本法、市场法和收益法。然而成本法和市场法的使用有较大的局限性。比如，成本法对于企业财务数据的质量要求较高，市场法要求有活跃市场及充足的市场交易价格数据，而这一条件往往不具备，等等。相比之下，收益法是国际公认的且在实务中广泛应用的一种评估无形资产和企业价值的方法，是通过估算评估对象未来预期收益的现值来判断资产价值，确定企业在现实市场的公平市场价值的一种方法。
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